| 2001年(平成13年) 3月 | 資本金1,000万円をもって株式会社ジーンテクノサイエンスを設立 （本社：札幌市北区北15条西4丁目21番地733） |
| 2001年(平成13年) 6月 | 資本金2,000万円に増資 |
| 2001年(平成13年) 9月 | 株式会社ホクドー、株式会社新薬開発研究所、日本レーザ電子株式会社、株式会社免疫生物研究所と共に「Bio Infomatics札幌コンソーシアム」を形成 |
| 2002年(平成14年) 3月 | 資本金3,500万円に増資 |
| 2002年(平成14年) 6月 | 独立行政法人産業技術総合研究所北海道センター内に研究開発部門を開設 （研究開発部門：札幌市豊平区月寒東2条17丁目2番1号） |
| 2002年(平成14年) 7月 | 「小脳機能不全による運動失調モデルの作製」事業により経済産業省の創造技術研究開発費補助金の交付を受ける |
| 2002年(平成14年) 7月 | 「創薬開発のための疾患モデルの新規遺伝子探索」事業により株式会社ホクドー、株式会社新薬開発研究所、株式会社免疫生物研究所と共に財団法人北海道中小企業総合支援センターの共同研究開発補助金の交付を受ける |
| 2002年(平成14年) 8月 | 独立行政法人産業技術総合研究所より「AISTベンチャー企業（成果創出型）」として認定される |
| 2003年(平成15年) 11月 | 本社を産業技術総合研究所北海道センター内に移転 （本社ならびに研究開発部門：札幌市豊平区月寒東2条17丁目2番1号） |
| 2004年(平成16年)4月 | 資本金7,900万円に増資 |
| 2006年(平成18年)2月 | 資本金1億6,400万円に増資 |
| 2007年(平成19年)4月 | 資本金2億1,400万円に増資 |
